MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_2

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017320	GTG	2	6	3	8	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017320	T	6	6	13	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017320	CGAA	2	8	41	48	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017320	A	6	6	1270	1275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017320	AAAG	2	8	1296	1303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017320	AG	3	6	1302	1307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017320	AGG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017320	AGG	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017320	A	7	7	1382	1388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017320	GGC	2	6	1429	1434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017320	A	7	7	1444	1450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017320	TAT	2	6	1459	1464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017320	TAA	2	6	1490	1495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017320	T	9	9	3055	3063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017320	G	6	6	3064	3069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017320	GTT	2	6	3071	3076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017320	AATA	2	8	3078	3085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017320	TAAGT	2	10	3139	3148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017320	ATT	2	6	3224	3229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017320	CAA	2	6	3230	3235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017320	TAT	2	6	3247	3252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017320	T	6	6	3255	3260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017320	TTCCAT	2	12	3341	3352	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017320	CCT	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017320	A	6	6	3587	3592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017320	GCTG	2	8	3699	3706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017320	GTT	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017320	CTG	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017320	GTG	2	6	3812	3817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017320	TGGC	2	8	3832	3839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017320	GCA	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017320	CCTA	2	8	4042	4049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017320	A	7	7	4087	4093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017320	TAC	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017320	ACC	2	6	4243	4248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017320	GGT	2	6	4494	4499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017320	ATAA	2	8	4520	4527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017320	GAAT	2	8	4632	4639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017320	ACA	2	6	4715	4720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017320	T	7	7	4740	4746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017320	TAT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017320	AGT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017320	TACC	2	8	5236	5243	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017320	A	6	6	5542	5547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017320	T	6	6	5560	5565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017320	T	6	6	5947	5952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017320	GCA	2	6	6366	6371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017320	G	6	6	6384	6389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017320	CGC	2	6	6726	6731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017320	AT	3	6	6776	6781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017320	CTG	2	6	6797	6802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017320	GCC	2	6	6813	6818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017320	T	6	6	6819	6824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.